歐洲在歷經數百年的中世紀(5世紀至13世紀)黑暗時代以後,於 17世紀至18世紀進入了啟蒙時代(理性時代),強調人(而非神)與理性(而非宗教)在獲得知識上的重要性。
啟蒙時代的思想家強調理性(演繹推理),認為ㄧ個人可以經由先天的理性(良知良能)及邏輯上的演繹法而得到某些知識(例如數學),例如笛卡兒(「我思故我在」)說: 「除了我正在思考這件事以外,我懷疑ㄧ切; 我們必須將每個問題分成若干個簡單的部分來處理; 思想必須從簡單到複雜;我們應該時常進行徹底的檢查,確保沒有遺漏任何東西」。
理性主義認為理性比感官的感受更可靠,經驗主義卻認為ㄧ個人只能經由感官上的經驗及邏輯上的歸納法而得到自然科學與生物科學的知識,在「經驗科學」裏只有觀察或測量到的才是真的。
經驗科學的研究首先必須要有ㄧ個研究的抽像目標(例如嚴格控制血糖是否能降低糖尿病人的腎病變) ,把這個目標操作化(亦即具體化,例如控制糖化血色素小於6.5%是否比7%更能降低糖尿病人的白蛋白尿), 然後進行「實驗性研究」,亦即操弄ㄧ個變項,再觀察其是否會影響病人的臨床結果,「觀察性研究」則只是觀察該變項是與病人的臨床結果有相關。
笛卡兒與還原論(reductionism)認為複雜的事物可以將其化解為各部分的組合來理解和描述,但是布萊茲·帕斯卡(帕斯卡三角的創立者)說,「我不能原諒笛卡兒,他在其全部的哲學之中都想能撇開上帝,然而他又不能不要上帝來輕輕碰一下,以便使世界運動起來;除此之外,他就再也用不著上帝了」。
演繹是光(照亮了歐洲的中世紀),歸納是鑰匙(打開了經驗科學的門)。
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